Biomerkers worden gebruikt in de preventie, bij het screenen op bepaalde ziekten en bij het opsporen van bepaalde aandoeningen. Maar ze zijn ook bijzonder doeltreffend om te voorspellen of een bepaalde behandeling al dan niet zal aanslaan. Onze focus ligt op biomerker identificatie voor minimaal invasieve diagnostische applicaties, waarbij we liefst werken met vloeibare biopsieën (urine, bloed en CSF). Deze focus zorgt ervoor dat we unieke kennis en kunde hebben opgebouwd op het gebied van staalvoorbereiding en data analyse. Naast vloeibare stalen, gebruiken wij ook vers en gefixeerd weefselmateriaal voor biomerker ontwikkeling door gebruik te maken van MALDI- gebaseerde beeldvorming.
Eiwitbiomerkers
Eiwitten zijn vanuit functioneel standpunt de belangrijkste bouwstenen van de cel en veranderingen in hun functioneren liggen ten grondslag aan velerlei ziektes. Op basis van veranderde eiwitten kunnen ziekteprocessen vastgesteld worden. Deze kunnen circuleren als vrije biomerkers of verpakt zitten in zogenaamde extracellulaire vesikels*. VITO maakt gebruik van state-of-the-art massaspectrometrie voor het identificeren en opsporen van (panels van) eiwitbiomerkers.
Als toepassingen kijken we vooral naar kanker (blaas- en longkanker) en neurodegeneratieve ziekten (dementie).
Immunopeptidomics
Immuuntherapie en gepersonaliseerde geneeskunde worden steeds meer belangrijke wapens in het arsenaal aan therapieën tegen verschillende vormen van kanker. Immuuntherapie kan gericht zijn op het opheffen van de remming van een immuunrespons (immuuncontrole - remmingstherapie) en ook op het versterken van het potentieel van immuuncellen door ze te richten op tumorspecifieke antigenen. Elke cel stelt zijn gezondheidstoestand bloot aan immuuncellen door peptiden op het celoppervlak aan te bieden. Analyse van deze immuunpeptiden kan belangrijke inzichten opleveren in kankeronderzoek. Met ons platform analyseren we peptiden die aanwezig zijn in tumorcellen (de zogenaamde immunopeptidomics) met het oog op toepassingen in T-celtherapie, immunotherapie en gepersonaliseerde vaccinatie.
Concreet is ons doel het wegwerken van enkele van de bestaande beperkingen van de analyse (methodologie massaspectrometrie en data-analyse) en zetten we ons state-of-the-art immunopeptidomics platform in voor toepassingen op het gebied van oncologie (long- en darmkanker) .
